Hiện nay, mức thu tối đa 0,5% áp dụng đối với công trình nhóm A, không quá 1% đối với công trình nhóm B và không quá 2% đối với công trình nhóm C. Riêng đối với nhà ở riêng lẻ, mức thu có thể tính theo diện tích xây dựng, nhưng tối đa không quá 35.000 đồng/m2, được áp dụng theo nguyên tắc giảm dần theo cấp nhà. Tức là mức thu đối với nhà cấp IV thấp hơn nhà cấp III, nhà cấp III thấp hơn nhà cấp II... và mức thu áp dụng đối với nhà ở nông thôn thấp hơn nhà ở đô thị.
Theo Bộ Tài chính, chính sách thu phí hiện nay còn có những tồn tại nhất
định. Các địa phương mỗi nơi ban hành mức thu, miễn, giảm phí khác nhau. Có địa
phương quy định thu phí, có địa phương lại không thu nên dẫn đến không công
bằng về trách nhiệm. Cụ thể, một số địa phương đã ban hành chính sách miễn thu phí
xây dựng cho các đối tượng như: Nhà ở cho đối tượng chính sách; các công trình
nhà ở tái định cư, nhà ở cho người có thu nhập thấp; các công trình giáo dục, y
tế, văn hóa, thể thao,...Do đó, việc miễn phí xây dựng sẽ tạo nên sự công bằng
và đồng nhất giữa các địa phương, tránh trường hợp nơi thu, nơi miễn.