Theo đó, Thành phố kiến nghị, nếu cho phép áp dụng giá đất do UBND Thành phố quy định thì việc thu tiền sử dụng đất sát giá thị trường bắt đầu từ thời điểm nào và Thành phố có được áp dụng hệ số điều chỉnh giá đất (theo hướng dẫn của Bộ Tài chính) hay không.
Thành phố hiện còn tồn đọng tồn đọng 4.569 hồ sơ đã nộp trước ngày 1/3/2011 chưa được hướng dẫn thu tiền sử dụng đất đối với phần diện tích vượt hạn mức.
Nếu thu tiền sử dụng đất sát giá thị trường theo Quyết định 64/2011/QĐ-UBND thì phần diện tích vượt hạn mức lớn hơn 50% hạn mức giao đất ở mới sẽ thu tiền sử dụng đất sát giá thị trường. Tuy nhiên, việc xác định như thế nào là giá thị trường không hề đơn giản.
Nếu áp dụng hệ số điều chỉnh giá đất theo Quyết định 28/2012 của UBND Thành phố, hệ số điều chỉnh giá đất của toàn bộ phần diện tích vượt hạn mức đất ở sẽ nộp tiền sử dụng đất theo hệ số K bằng 2, tức hai lần bảng giá đất do Thành phố ban hành và công bố hằng năm.