UBND thành phố đã chỉ đạo vẫn tiếp tục triển khai chương trình 12.500 căn và phải kết thúc trong năm 2013.
Tuy nhiên, UBND quận 2 cho rằng, quận chỉ còn thiếu khoảng 1.700 – 1.800 căn nhà tái định cư phục vụ cho khu đô thị này. Như vậy, chương trình 12.500 căn nhà tái định cư sẽ bị thừa. Song, UBND thành phố đã chỉ đạo vẫn tiếp tục triển khai chương trình 12.500 căn và phải kết thúc trong năm 2013. Về nhu cầu sử dụng số căn nhà tái định cư còn lại, thành phố giao sở Xây dựng phối hợp với các sở và quận, huyện cân đối quỹ nhà.
Theo tìm hiểu của báo Sài Gòn Tiếp Thị, không chỉ tại khu đô thị mới Thủ Thiêm mà nghịch lý thiếu – thừa nhà tái định cư đang tồn tại ở nhiều dự án khác. Theo báo cáo mới nhất của sở Xây dựng với ban Kinh tế ngân sách HĐND TP.HCM, hiện toàn thành phố vẫn còn tồn đọng khoảng 4.482 căn hộ/nền tái định cư. Tuy nhiên, theo sở Xây dựng, với số lượng tồn đọng nêu trên cũng chỉ đáp ứng được 30% nhu cầu tái định cư của thành phố trong giai đoạn 2012 – 2015, bởi chỉ tính đến giữa năm 2012, toàn thành phố có tới gần 1.430 hộ tạm cư phát sinh mới từ 24 dự án. Trong đó, có 574 hộ (40%) tạm cư do di dời khẩn cấp khỏi ba chung cư hư hỏng nặng: Cô Giang (quận 1), Nguyễn Kim (quận 10), Lý Thường Kiệt (quận 11)… Do vậy, theo sở Xây dựng, thành phố vẫn phải tiếp tục chuẩn bị thêm hàng chục ngàn căn hộ/nền nhà nữa mới đủ nhu cầu tái định cư.
Trong khi đó, theo sở Tài chính TP.HCM, vì một số quận, huyện khi mua sẵn số nhà cho quỹ tái định cư thì gặp tình trạng sau đó giá nhà đất xuống giá nên bị lỗ. Do đó, sở Tài chính đã kiến nghị thành phố cần cân nhắc kỹ việc dự trữ quỹ nhà tái định cư vì tốn nhiều kinh phí trong khi các dự án triển khai chưa biết bao giờ xong.
Ban quản lý Đầu tư – xây dựng khu đô thị mới Thủ Thiêm cũng đã kiến nghị thành phố thay đổi phương thức quản lý theo hướng: đơn vị nào sử dụng quỹ nhà này sẽ có trách nhiệm quản lý và chuẩn bị nguồn vốn trả cho nhà đầu tư. Bởi mới đây báo cáo với UBND TP.HCM về chương trình 12.500 căn nhà tái định cư, sở Tài chính cho biết để xây dựng đủ 12.500 căn hộ tái định cư thì tối thiểu ngân sách thành phố phải bỏ ra từ 13.000 – 14.000 tỉ đồng.